bed文件格式|请问哪位知道linux下sam格式转成bed文件格式的命令

bed文件格式|请问哪位知道linux下sam格式转成bed文件格式的命令的第1张示图

『壹』 ipad越狱后可以直接网站下载bed格式吗我下载了一个bed格式怎么也不能打开'是还得装个安装软

1、是deb格式,不是bed。。。2、在Cydia中有一个目录,启动时会自动安装里面的deb文件。你在IPAD上装个iTools或者iFunbox,随便哪个都行,然后把从网上下载的deb文件用上述工具复制进去即可。具体目录是/private/var/root/Media/Cydia/AutoInstall/ 然后重启IPAD。deb文件会自动安装,安装后会自动删除。有时候重新启动一次还不行,多试几次即可。3、最简单的方法!IPAD上装个iFile,然后把deb文件拷到IPAD里,随便哪个位置。拷完你用iFile找到他,点击后就可以直接安装程序,然后重启。手打。。。求给分

『贰』 ADMIXTURE图怎么看

1.2 admixture支持的格式

plink的bed文件或者ped文件

EIGENSTRAT软件的.geno格式

注意:

如果你的数据格式是plink的bed文件, 比如a.bed, 那么你应该包含a.bim, a.fam

如果你的数据格式是plink的ped文件, 比如b.ped, 那么你应该包括b.map

1.3 选择合适的分群数目k值

这里你要有一个k值, 如果你不知道你的群体能分为几个类群, 可以做一个测试, 比如从1~7分别分群, 然后看他们的cv值哪个小, 用那个k值.

『叁』 用用友U8帐套备份出来的文件是UfErpAct和UFBEDCC.tmp,而不是BA格式和lst格式怎么改才正确急求

你这个备份是异常的,.TMP是临时文件,没有转换成BAK文件,这不是手工改能改过来的,建议重新备份。

『肆』 如何用perl处理bed文件

#!/usr/bin/perl -wuse strict;die "perl $0 <bedfilename>\n" unless(@ARGV == 1);open IN,$ARGV[0];while(<IN>){ chomp; my @tmp=split/[\t ]+/,$_; print "$tmp[1]\t$tmp[5]\n";}close IN;将上面代码保存为run.pl,假设你的蛋白质序列文件为a.txt 运行的时候,在命令行输入 perl run.pl a.txt 回车即可

『伍』 bededit命令在win7中怎么找大神教我吧。。

1.工具性质需要注意的是,BCDEdit不是一个运行于图形界面下的程序,而是一个命令行工具,该文件(Bcdedit.exe)位于“\Windows\System32”目录下。2.启动要执行BCDEdit,首先应进入命令行窗口,并要将操作用户并提升至管理员权限。另外,该工具依赖于参数,如果不带参数,则不能正常使用。在命令行窗口中,转到系统目录如“C:/windows/system32”下,然后输入“bcdedit<参数>”即可。也可直接在任意目录运行,因为System32目录本身在环境变量“Path”的范围内。3.BCDEdit命令核心(1)帮助bcdedit/?:显示全部的命令帮助(都只是概述)。bcdedit.exe/?<命令>:显示指定命令参数的详细信息(无需带斜杠)。使用中对其他任何可用参数也均可使用本命令格式查看该参数的具体说明。(2)Enum通过命令行工具Bcdedit,我们可以添加、删除及修改BCD(BootConfigurationData)中的对象。在BCD中,每个对象均具有唯一的GUID(GloballyUniqueIdentifier:全局唯一标识符),如系统中的每块硬盘、每个分区的GUID(全局唯一标识符)均不相同。在BCD中,硬盘或分区的GUID可分为如下几类:{ntldr}:指存在上代NT50系列操作系统(WindowsXP/2000/2003)的硬盘或分区;{default}:默认所在硬盘或分区;{current}:当前硬盘或分区;{<GUID>}:类似于这个格式的GUID指其他安装了操作系统的硬盘或分区。(注:相应的GUID可通过“bcdedit”或“bcdedit/enumall”命令查看。这样会显示BCD当前的启动设置数据,包含了所有在BCD记录中的操作系统,均能显示其GUID,用户可以此作更改启动数据的参考。)(3)保险措施(使用BCDEdit备份与恢复启动选项)在对WindowsNT60的启动选项修改之前,最好先对其备份,以防万一操作失误或其他故障导致系统无法启动。bcdedit/export<目录>:将启动设置备份到指定的目录下;bcdedit/import<目录>:恢复之前备份在指定目录下启动选项。注:当需要还原备份的启动选项时,应仔细检查备份的启动选项是否对应于自己所需要的,否则重新设置会比较麻烦。

『陆』 如何将csv文件转换为bed文件 brower extensible data

小米通讯录备份文件格式vcf格式。 转换一下就可以了, 先装office ,任何版本。然后就是导入和复制 打开 windows 自带的 Outlook Express 软件,选择 联系人—打开通讯簿 在通讯簿中选择 文件—导入—-其它通讯簿.

『柒』 请问哪位知道linux下sam格式转成bed文件格式的命令

sam to bed: samtools view<SAMFILENAME.sam> -Sb | bamToBed -istdin > BEFILENAME.bed

『捌』 amv格式转换器

你要的转换器地址(我再没发现比这好的呢)http://58.251.57.206/down1?cid=&t=2&fmt=&usrinput=160*120&dt=2002000黑糖群侠传没amv格式的,下面的是BT地址,下载速度也快,你下载下来转换吧http://58.251.57.206/down?cid=&t=13&fmt=

『玖』 请问如何将cel文件转化成bed文件

把Excel中的内容转换成word:

选取Excel里面的内容复制

打开Word文档

编辑→选择性粘贴

无格式的文本→确定。</ol>

将Excel表格完美转换成word文档:

Excel编辑好一个表格,然后点击“文件”→“另存为web页”。web页就是网页文件,在“保存选项”处把“保存整个工作簿”调整成“选择:工作表”,把默认文件名“page”根据实际情况改成你所需要的名字,如:“工作表”,再点击“保存”。注意,在改名时绝对不可以把后面的去掉,只要改“.”前面的部分就可以了。

2.找到刚才保存好的“工作表”,在文件上面直接点击鼠标右键,选择“打开方式”最下面的“打开程序”选项,在列表中找到“Word”,选中并确定。

3.用Word程序打开该文件后,不要做任何编辑操作,直接点击“文件”→“另存为”,把文件名改成“工作表Word版”,把保存类型选成“Word文档”,再点击“保存”即可。

4.现在再打开刚才保存的“工作表word版”文件看看,是不是转换得很完美。

『拾』 如何去获得plink的ped和map文件

BED文件格式是一个可变方式的数据线,用来描述注释的数据。建议用plink转换为.map和.ped格式,其中ped文件中的数据就是想要的。用EditPlus打开即可。或者用excel可以打开。BED线有3个要求的字段和9个额外的字段。每条线的字段数目必须是任意单条数据的在注释上一致。可选字段的序试结合低数字的字段必须流行如果高位字段被使用。首先是三个要求的BED字段:1.chrom,染色体或scafflold的名字(egchr3,chrY,chr2_random,scaffold0671).2.chromStart染色体和scaffold的起始位置,第一个染色体的位置是0.3.chromEn染色体和scaffold的结束位置,染色体的末端位置没有包含到显示信息里面。例如,首先得100个碱基的染色体定义为chromStart=0.chromEnd=100,碱基的数目是0-999个额外的可选BED字段是:1.name定义BED的名字2.score0到1000的分值,如果track线在注释时属性设置为1,那么这个分值会决定现示灰度水平,数字越大,灰度越高。下面的这个表格显示GenomeBrowser3.strand定义链的''+”或者”-”4.thickStart开始的位置,这个特征是画thickly(例如,在开始的编码显示基因的显示5.thickEnd结束的位置,这个特征是画thickly例如,在结束的编码显示基因的显示6.itemRGBAnAGB值的形式,R,G,B(eg.255,0,0),如果tracklineitemRgb属性是设置为'On”,这个RBG值将决定数据的显示的颜色在BED线。注意,它推荐简单的颜色方案(eightcolororless)是用作这个属性避免颜色资源在基因组浏览器上过多7.blockCountBED线在exon的block数目8.blockSize用逗号分割blocksize,这个item的列表对应于BlockCount9.blockStarts-用逗号分割的列表,所有的blockStart位置应该被计算相关于chromStart,这个数字的项应该对应于blockCount

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